Item – Theses Canada

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OCLC number
891354656
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Author
Varin, Thibaut.
Title
Métagénomique des tapis microbiens polaires
Degree
Thèse (Ph. D.)--Université Laval, 2013.
Publisher
Québec : Université Laval, 2013.
Description
1 online resource (xix, 239 p.) :fichier PDF (4,89 Mo).
Notes
Titre de l'écran-titre (visionné le 2 mai 2013).
Bibliogr.
Abstract
Le domaine de l'écologie microbienne est en pleine effervescence grâce à l'avènement de la métagénomique et des techniques de séquençage de nouvelle génération (SNG), qui nous apportent une meilleure compréhension de la structure et du fonctionnement des communautés microbiennes de la biosphère. Cette thèse illustre ainsi une manière de tirer profit de l'utilisation de ces nouvelles technologies, dans le but d'étudier un écosystème qui a été très peu caractérisé jusqu'à maintenant, en l'occurrence les tapis microbiens polaires. Les analyses métagénomiques de différents tapis microbiens polaires ont permis dans un premier temps, de dresser une description générale de la taxonomie et du potentiel fonctionnel des communautés microbiennes en question, pour ensuite nous permettre d'examiner de façon plus exhaustive deux de leurs particularités métaboliques. L'existence éventuelle d'un système de recyclage des nutriments au sein même des tapis microbiens étudiés a été soulevée étant donné le caractère oligotrophique de leur milieu environnant. L'analyse des profils métagénomiques des tapis microbiens de l'Arctique a permis de mettre en évidence plusieurs groupes de gènes impliqués dans des mécanismes de décomposition et de récupération qui donneraient la possibilité à ces communautés de retenir et de recycler leurs nutriments au sein de leur microenvironnement benthique. Un autre aspect des tapis microbiens polaires sur lequel je me suis penché lors de ce doctorat, concerne la propension des membres peuplant ce type d'écosystème à s'acclimater à un large panel de stress découlant de la nature extrême de leur habitat. La présence de divers procédés métaboliques d'adaptation au froid et à d'autres stress a été observée à partir de l'analyse du métagénome des ces communautés arctiques et antarctiques, en concordance avec les différents niveaux de représentation des principaux groupes bactériens. Cette thèse démontre à quel point le recours aux disciplines "méta-omiques", peut nous amener vers une meilleure compréhension de l'écologie microbienne, et comment l'émergence de ces technologies a permis d'aborder différemment des thèmes aussi fondamentaux que celui de la biogéographie des microorganismes.
Other link(s)
Accès via Archimède
Bibliothèque et Archives Canada / Library and Archives Canada
hdl.handle.net
Subject
Microbial mats.
Microbial genomics Data processing.
Microbiology Polar regions.
Mattes microbiennes.
Génomique microbienne Informatique.
Microbiologie Régions polaires.
Mattes microbiennes
Génomique microbienne -- Informatique
Microbiologie -- Régions polaires